原位杂交是用来分析DNA序列的方法，是一种非凝胶电泳技术。原位杂交的原理是将探针DNA标记上荧光染料，在高温下与待检测样品的DNA序列杂交，通过显微镜和成像设备来观察是否有信号，从而确定待检测样品中是否含有特定的DNA序列。
在基因组学中，原位杂交被广泛应用于基因定位、基因扩增、DNA序列的检测与定位等领域。常常用于检测染色体异常和突变，同时也可以用来检测病毒、细菌等微生物的存在。
使用原位杂交进行基因组分析时，需要先设计探针DNA，这种DNA分子通常是数百至数千碱基长的单链DNA分子，其具有特异性，可以精确地识别指定的DNA序列。然后再将探针DNA标记上荧光染料，如荧光素、罗丹明和银粒等，使其能够被显微镜或成像设备检测到。
原位杂交是一种重要的基因组学分析方法，它能够对DNA序列进行快速、准确的检测和定位，在医学、农业、生物技术等领域有着广泛的应用前景。