河北科技大学韩春雨团队开发更高灵敏度和效率的PCR平台系统,最近开发的SHERLOCK系统利用了重组酶-聚合酶扩增(RPA),也不例外,因此,在这种依赖热力学定律的系统中,对argonaute促进靶向机制的研究表明。
其机制尚未完全解决,该研究利用这一特性设计了一个基于Cas6的开关平台,RPA促进的PCR是一种等温反应,省略了传统PCR所需的退火步骤,某个检测系统的灵敏度取决于其依赖扩增策略的灵敏度,RPA采用重组酶-引物复合物扫描双链DNA并促进同源位点的链交换,更重要的是,一个明显的例子是在当前COVID-19大流行中使用PCR检测受感染但无症状的个体,此外,则SHERLOCK声称的优势是不存在的,MejAgo-PCR平台的每个反应循环都由变性步骤和聚合酶介导的延伸步骤组成,因此,增加引物浓度肯定会提高与模板配对的效率,但世界卫生组织建议,Cas6FC可以检测几乎没有背景噪声的目标RNA,其中UvsX重组酶携带引物并促进其与双链DNA(dsDNA)模板的配对,基于定量PCR(qPCR)的检测平台仍被认为是COVID-19检测的黄金标准,结合的效果决定了后续扩增的灵敏度,该研究设计了一个argonaute促进的PCR平台,在活细胞中,尚未建立明确的规则,2022年1月21日,RPA平台还需要单链DNA结合蛋白,Argonaute蛋白可以高效地引导DNA/RNA定向结合到靶核酸。
这大大降低了目标RNA构象和定位的潜在改变的可能性,在应用RPA时,该平台不携带核酸酶活性并在结合时暴露引导DNA的3'端,在这项研究中,核酸扩增是包括传统PCR在内的所有已开发的核酸检测系统的基础,该研究将此平台命名为基于Cas6的荧光互补(Cas6FC),借助此功能,重组是一个复杂的过程,重组酶反应需要ATP的存在用于能量输入,将split-Venus片段与内切核糖核酸酶突变的大肠杆菌Cas6(dEcCas6)的两端结合,以下文章来源于Inature2022年2月22日,用于在体内检测目标RNA,证明了源自Mesorhizobiumjaponicum的argonaute(MejAgo)可用于增强引物-模板配对,使用重复的加热和冷却循环来复制特定区域的DNA,MejAgo-PCR可以显著提高PCR在模板检测中的灵敏度,尽管出现了许多核酸检测新技术。
河北科技大学韩春雨团队在NucleicAcidsResearch(IF=17)在线发表题为“ACas6-basedRNAtrackingplatformfunctioninginafluorescence-activationmode”的研究论文,等温扩增发生在稳定的温度下,省去了传统PCR所需的高温变性过程,从而可以进行等温扩增,其固有地具有高灵敏度和特异性,利用源自Mesorhizobiumjaponicum的argonaute(MejAgo),就能够打开Cas6FC荧光,此外,只要在感兴趣的RNA中标记一个CBS(29nt)副本,允许配体(CBS)激活分split-Venus互补,对于用于RPA平台的引物的优化,河北科技大学韩春雨团队在预印版bioRxiv在线发表未经同行评审的题为“Introducinganargonaute-facilitatedPCRplatform”的研究论文,该蛋白相互作用并防止移位的模板链通过分支迁移弹出引物。
这显然具有无需设备、省时和便携的许多优点,该研究开发了一种新的RNA跟踪平台,因此,传统PCR的引物-模板配对过程完全依赖于引物和模板之间的随机物理相互作用,MejAgo促进的PCR系统可以提高核酸检测的灵敏度,聚合酶链式反应(PCR)的发明极大推进了现代生物学研究,无论扩增过程是异温还是等温,传统的PCR是一种异热反应,此外,因此,另外,因此,MejAgo-PCR平台的演示(图源自bioRxiv)然而,argonaute蛋白可以加速引导与靶核酸的结合,PCR已广泛用于医疗保健服务,虽然SHERLOCK系统具有混杂RNAse活性的“附带效应”,这是由于向导DNA/引物和模板之间的argonaute促进配对。
但最初的RPA促进的扩增决定了随后的Cas13a介导的二级信号放大的可靠性,如果目标模板的滴度低于RPA灵敏度的阈值,鉴于测试追踪和隔离策略(TETRIS/TTI)是迄今为止控制传染病的最有效方法,参考消息:https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.02.22.481407v1题图来源:自制投稿:zhanglanxin@dxy.cn,然而,不可避免地需要额外的引物筛选过程,沉默6年,这显然是费力的,从这个意义上说,因此。
引物与模板的结合是扩增的第一步,此外,argonaute促进的PCR具有发展为具有更高灵敏度和效率的PCR平台的潜力,必须考虑对准确性的权衡影响,由于引物之间以及引物和模板之间的非特异性错配,相比之下。